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    10ノード/20CPU/240コア総メモリ容量640GB HPCクラスタシステム導入事例

    用途・分野|HPCクラスタシステム導入事例

    管理ノード、計算ノード(10ノード/20CPU/240コア総メモリ容量640GB)から成る VT64 Server クラスタシステムを、公立大学の研究室へ納入しました。

    ネットワークは、NIS/NFS用・MPI用・IPMI管理用の3系統となっております。
    既存の静音ラックに搭載したクラスタシステムと併せ、タンパク質立体構造の解析など 生命現象の分子レベルでの解明にお使いいただきます。

     

    納入したクラスタシステム

     

    clusterres-1

     

    ◆納入スペック◆

    管理サーバー 1台
    VT64 Server E5-2S(V2)
     
    CPU Intel Xeon E5-2650 V2 2.6GHz 8Core×2
    メモリ 16GB(DDR3-1600 ECC Registered 2GB×8)
    HDD(System) SATA 500GB 7,200rpm×2 (HardwareRAID-1)
    HDD(Data) SATA 2TB 7,200rpm×4
    (HardwareRAID-5、Hotspare用1本)
    ネットワーク  10/100/1000Base-T×2(On-board)
    増設用NIC(GbE) x 1
    電源 740W (1+1 Redundant)
    計算サーバー 4台
    VT64 Server E5-2T(V2)
      
    CPU Intel Xeon E5-2695 V2 2.4GHz 12Core×2
    メモリ 64GB(DDR3-1866 ECC Registered 8GB×8)
    HDD SATA 500GB 7,200rpm×2 (HardwareRAID-1)
    ネットワーク 10/100/1000Base-T×2(On-board)
    電源 1280W (1+1 Redundant)

     

    周辺機器
     
    Rack 16Ports Gigabit Ethernet Switching Hub×3
    GbE Switch 16Ports Gigabit Ethernet Switching Hub×3
    LAN Cable Category6 UTP Cable (3m) ×33
    Category6 UTP Cable (5m) ×1
    無停電電源装置 1.1kVA 2U Rackmount Type×1

     

    Softwareおよび環境構築
     
    OS Cent OS 6系
    Compiler Intel Cluster Studio XE 2013 Linux AC Single User License
    ※Intel Fortran, C/C++, MKL, MPI Libraryインストール
    VT-HPC Package  
    Message Passing Interfaceライブラリ OpenMPI、MPICH、MVAPICH2
    分散型ワークロード管理システム TORQUE
    ノード間監視ツール Ganglia
    高速フーリエ変換用アルゴリズム FFTW2/3
    ノード外温度湿度監視ソフトウェア VT見張り番
    高速ファイル転送ソフト

    Skeed Silver Bullet (OEM ファイル制限 2GB/同時接続2)